Auf einen Blick
- Aufgaben: Entwickle mathematische Modelle für komplexe biologische Daten und arbeite an innovativen Forschungsprojekten.
- Unternehmen: Führendes Forschungsinstitut mit modernster Ausstattung und kollaborativer Kultur.
- Vorteile: Unterstützende Umgebung, Möglichkeiten zur beruflichen Entwicklung und Teilnahme an multidisziplinären Projekten.
- Weitere Informationen: Enge Zusammenarbeit mit Experten aus verschiedenen wissenschaftlichen Disziplinen.
- Warum dieser Job: Gestalte die Zukunft der Metabolismusforschung und arbeite mit großen Datensätzen aus klinischen Studien.
- Qualifikationen: PhD in einem relevanten Bereich und Erfahrung in mathematischer Modellierung und maschinellem Lernen.
Dysregulation of lipid metabolism plays a key role in the development and progression of metabolic disorders, including obesity, type 2 diabetes, and metabolic dysfunction-associated steatotic liver disease (MASLD). We are seeking eine hochmotivierte Wissenschaftlerin oder einen hochmotivierten Wissenschaftler in Computational und Systems Biology, um an einem von der Schweizerischen Nationalfonds (SNSF) finanzierten Projekt zu arbeiten, das darauf abzielt, unser Verständnis des menschlichen Lipidstoffwechsels bei MASLD zu verbessern. Das Projekt konzentriert sich auf die Modellierung des menschlichen Stoffwechsels durch die Integration klinischer Daten mit experimentellen Modellen. Es umfasst biochemische und molekulare Daten aus mehreren Geweben und Bioflüssigkeiten, um gewebespezifischen Stoffwechsel, metabolische Wechselwirkungen zwischen Organen sowie Nährstoffaufnahme, -umwandlung und -freisetzung zu untersuchen. Das Projekt kombiniert statistische Modellierung, Systembiologie und in silico metabolische Modellierung mit klinischen, transkriptomischen, proteomischen, metabolomischen/lipidomischen, räumlichen molekularen Bildgebungs- und experimentellen metabolischen Flussdaten, um neue Einblicke in die komplexen metabolischen Veränderungen zu gewinnen, die MASLD zugrunde liegen.
Was Sie erwarten können:
- Entwicklung und Anwendung mathematischer, statistischer und maschineller Lernmodelle auf komplexe, hochdimensionale und multimodale biologische und klinische Datensätze, einschließlich räumlicher und bildgebender Daten
- Modellierung des Lipid- und Nährstoffstoffwechsels unter Verwendung von compartmentalen, kinetischen, mechanistischen, metabolischen Netzwerk- oder physiologisch basierten Ansätzen
- Rekonstruktion und Modellierung gewebespezifischer Stoffwechselnetzwerke und Validierung von Modellvorhersagen mit experimentellen Daten
- Teilnahme an und Beitrag zu multidisziplinären und kollaborativen Forschungsprojekten
- Vorbereitung, Präsentation und Kommunikation wissenschaftlicher Ergebnisse bei internen Meetings, internationalen Konferenzen und durch peer-reviewed Publikationen
Ihr Profil:
- PhD oder gleichwertig in Computational Biology, Systems Biology, angewandter Mathematik, biochemischer Ingenieurwissenschaft oder einem verwandten Bereich
- Starke Expertise in mathematischer und statistischer Modellierung, maschinellem Lernen und Systembiologie, mit Erfahrung in der Analyse hochdimensionaler, multimodaler oder multi-omics biologischer oder klinischer Daten
- Nachgewiesene Erfahrung in in silico metabolischer Modellierung, z.B. constraint-basierte oder genomweite metabolische Modellierung, Rekonstruktion metabolischer Netzwerke, kinetische oder metabolische Flussmodellierung oder datengestützte Simulation
- Kenntnisse in R, Python oder MATLAB und Erfahrung in der Integration experimenteller Daten mit computergestützten Modellen; Erfahrung in der Massenspektrometrie, räumlichen Omics, molekularer Bildgebung oder Gewebeabbildung ist ein starkes Asset
- Enthusiastischer und kollaborativer Wissenschaftler mit starken analytischen und problemlösenden Fähigkeiten, der in der Lage ist, unabhängig und in multidisziplinären Teams zu arbeiten, sowie ausgezeichnete schriftliche und mündliche Englischkenntnisse
Was wir bieten:
- Ein unterstützendes, kollaboratives und hochmodernes Forschungsumfeld mit Möglichkeiten zur wissenschaftlichen und beruflichen Entwicklung
- Teilnahme an multidisziplinären Forschungsprojekten an der Schnittstelle von Computational Biology, Systems Biology, Metabolismus, Multi-Omics, molekularer Bildgebung und klinischer Forschung
- Die Möglichkeit, mit großen Datensätzen aus präklinischen und klinischen Studien zu arbeiten
- Enge Zusammenarbeit mit Experten aus verschiedenen wissenschaftlichen und klinischen Disziplinen
Fragen zur Stelle? Für weitere Informationen kontaktieren Sie bitte Prof. Mojgan Masoodi, Leiterin der Forschung, INSELSPITAL, 3010 Bern.
Postdoc in Computational Systems Biology and Metabolic Modeling Arbeitgeber: INSELSPITAL
Die Insel Gruppe ist ein hervorragender Arbeitgeber, der eine anspruchsvolle und abwechslungsreiche klinische Tätigkeit in einem der grössten kardiovaskulären Bildgebungszentren der Schweiz bietet. Mit einem motivierten, interdisziplinären Team und umfangreichen Fortbildungsmöglichkeiten unterstützt die Insel Gruppe aktiv die individuelle Karriereentwicklung und fördert eine ausgewogene Work-Life-Balance durch flexible Arbeitsmodelle und familienfreundliche Angebote. Zudem profitieren Mitarbeitende von attraktiven Sozialleistungen und einer Unternehmenskultur, die Diversität und Chancengleichheit schätzt.
